بانک توسعه نوین (NDB) از مجموعه‌ای از ارکان مدیریتی شامل شورای حکام، هیئت‌مدیره، رئیس و معاونان تشکیل شده است. این ارکان هر یک وظایف مهمی در هدایت پروژه‌ها، مدیریت منابع و تصمیم‌گیری‌های کلان بانک دارند.
شورای حکام بالاترین مرجع تصمیم‌گیری بانک است و از یک نماینده در سطح وزیر و یک عضو علی‌البدل از هر کشور عضو تشکیل می‌شود. این شورا اختیار تصویب بسیاری از تصمیمات کلان را دارد، هرچند امور راهبردی همچون پذیرش اعضای جدید، اصلاح توافق‌نامه، تعیین رئیس و افزایش یا کاهش سرمایه از اختیارات غیرقابل تفویض آن است.
هیئت‌مدیره نهادی غیرمقیم است که وظیفه انجام تمامی فعالیت‌های اجرایی بانک را بر عهده دارد و تصمیمات تفویض‌شده از سوی شورای حکام را اجرا می‌کند. این هیئت از مدیرانی تشکیل می‌شود که توسط اعضای مؤسس و غیرمؤسس انتخاب می‌شوند.
رئیس بانک توسط شورای حکام و به صورت چرخشی از میان اعضای مؤسس انتخاب می‌شود. وی مسئول امور روزمره، مدیریت کارکنان و ریاست کمیته اعتبارات و سرمایه‌گذاری است. معاونان رئیس نیز با پیشنهاد وی و تصویب شورای حکام انتخاب می‌شوند.
